Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TUBA3CQ13748 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TUBA3CQ13748 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TUBA3CQ13748 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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TUBA3CQ13748 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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TUBA3CQ13748 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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TUBA3CQ13748 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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TUBA3CQ13748 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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TUBA3CQ13748 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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TUBA3CQ13748 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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TUBA3CQ13748 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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