Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTMR3Q13615 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms