Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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NAE1Q13564 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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NAE1Q13564 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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NAE1Q13564 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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NAE1Q13564 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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NAE1Q13564 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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NAE1Q13564 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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