Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 LINC02243-201ENST00000441841 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 LINC02509-201ENST00000508790 691 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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MKRN4PQ13434 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 CD226-207ENST00000582621 1458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
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MKRN4PQ13434 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC123767.1-204ENST00000523523 273 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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MKRN4PQ13434 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC027020.1-201ENST00000559349 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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