Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2P3Q13401 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms