Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE3BQ13370 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
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