Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SGCGQ13326 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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