Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RLFQ13129 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RLFQ13129 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RLFQ13129 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RLFQ13129 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RLFQ13129 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RLFQ13129 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RLFQ13129 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RLFQ13129 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RLFQ13129 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RLFQ13129 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RLFQ13129 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RLFQ13129 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RLFQ13129 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RLFQ13129 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RLFQ13129 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RLFQ13129 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RLFQ13129 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RLFQ13129 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RLFQ13129 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RLFQ13129 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RLFQ13129 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RLFQ13129 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RLFQ13129 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RLFQ13129 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RLFQ13129 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RLFQ13129 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RLFQ13129 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RLFQ13129 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RLFQ13129 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RLFQ13129 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RLFQ13129 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RLFQ13129 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RLFQ13129 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RLFQ13129 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RLFQ13129 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RLFQ13129 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RLFQ13129 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RLFQ13129 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RLFQ13129 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RLFQ13129 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RLFQ13129 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RLFQ13129 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RLFQ13129 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RLFQ13129 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RLFQ13129 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RLFQ13129 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RLFQ13129 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RLFQ13129 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RLFQ13129 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RLFQ13129 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RLFQ13129 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RLFQ13129 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RLFQ13129 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RLFQ13129 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RLFQ13129 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RLFQ13129 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RLFQ13129 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RLFQ13129 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RLFQ13129 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RLFQ13129 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RLFQ13129 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RLFQ13129 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RLFQ13129 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms