Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
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