Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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BNIP1Q12981 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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BNIP1Q12981 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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BNIP1Q12981 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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BNIP1Q12981 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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BNIP1Q12981 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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BNIP1Q12981 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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BNIP1Q12981 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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BNIP1Q12981 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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BNIP1Q12981 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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BNIP1Q12981 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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BNIP1Q12981 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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BNIP1Q12981 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BNIP1Q12981 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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