Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PTPRJQ12913 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PTPRJQ12913 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PTPRJQ12913 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PTPRJQ12913 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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