Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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