Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TFCP2Q12800 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TFCP2Q12800 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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