Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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FAM27E3Q08E93 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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FAM27E3Q08E93 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM27E3Q08E93 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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