Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNDQ07001 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms