Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms