Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms