Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms