Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ID3Q02535 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ID3Q02535 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ID3Q02535 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ID3Q02535 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ID3Q02535 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ID3Q02535 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ID3Q02535 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ID3Q02535 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ID3Q02535 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms