Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMF1P82094 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMF1P82094 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMF1P82094 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMF1P82094 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMF1P82094 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMF1P82094 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMF1P82094 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMF1P82094 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMF1P82094 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMF1P82094 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMF1P82094 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMF1P82094 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMF1P82094 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMF1P82094 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMF1P82094 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMF1P82094 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMF1P82094 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMF1P82094 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMF1P82094 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMF1P82094 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMF1P82094 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMF1P82094 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMF1P82094 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMF1P82094 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMF1P82094 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMF1P82094 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMF1P82094 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMF1P82094 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMF1P82094 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMF1P82094 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMF1P82094 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMF1P82094 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMF1P82094 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMF1P82094 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMF1P82094 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMF1P82094 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMF1P82094 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMF1P82094 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMF1P82094 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMF1P82094 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMF1P82094 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMF1P82094 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMF1P82094 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMF1P82094 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMF1P82094 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMF1P82094 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMF1P82094 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMF1P82094 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMF1P82094 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMF1P82094 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMF1P82094 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMF1P82094 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMF1P82094 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMF1P82094 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMF1P82094 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMF1P82094 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMF1P82094 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMF1P82094 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMF1P82094 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMF1P82094 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMF1P82094 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMF1P82094 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms