Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms