Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ERVFC1P60507 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms