Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DCDC1P59894 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms