Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAPAP54920 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAPAP54920 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAPAP54920 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAPAP54920 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAPAP54920 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAPAP54920 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAPAP54920 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAPAP54920 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAPAP54920 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAPAP54920 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAPAP54920 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAPAP54920 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAPAP54920 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAPAP54920 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAPAP54920 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAPAP54920 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAPAP54920 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAPAP54920 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAPAP54920 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAPAP54920 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms