Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB1P54762 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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