Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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PGGT1BP53609 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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PGGT1BP53609 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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PGGT1BP53609 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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PGGT1BP53609 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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PGGT1BP53609 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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PGGT1BP53609 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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PGGT1BP53609 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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PGGT1BP53609 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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PGGT1BP53609 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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