Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNTBP49356 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNTBP49356 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNTBP49356 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNTBP49356 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNTBP49356 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNTBP49356 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FNTBP49356 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms