Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP12P39900 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP12P39900 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP12P39900 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP12P39900 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP12P39900 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP12P39900 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP12P39900 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP12P39900 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP12P39900 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP12P39900 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP12P39900 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP12P39900 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP12P39900 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP12P39900 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP12P39900 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP12P39900 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP12P39900 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP12P39900 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP12P39900 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP12P39900 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP12P39900 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP12P39900 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP12P39900 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP12P39900 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms