Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms