Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD10P28358 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms