Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms