Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms