Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDSP20132 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDSP20132 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDSP20132 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDSP20132 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDSP20132 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SDSP20132 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDSP20132 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDSP20132 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SDSP20132 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SDSP20132 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDSP20132 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDSP20132 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDSP20132 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDSP20132 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDSP20132 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDSP20132 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDSP20132 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDSP20132 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDSP20132 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDSP20132 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDSP20132 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDSP20132 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDSP20132 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDSP20132 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDSP20132 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDSP20132 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDSP20132 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDSP20132 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDSP20132 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDSP20132 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDSP20132 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDSP20132 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDSP20132 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDSP20132 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDSP20132 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDSP20132 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SDSP20132 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDSP20132 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDSP20132 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SDSP20132 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDSP20132 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SDSP20132 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SDSP20132 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDSP20132 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDSP20132 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDSP20132 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDSP20132 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDSP20132 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDSP20132 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDSP20132 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDSP20132 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDSP20132 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDSP20132 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms