Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2CP19387 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLR2CP19387 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
POLR2CP19387 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLR2CP19387 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms