Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 OR1I1-202ENST00000641398 5984 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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PDE6GP18545 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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PDE6GP18545 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 PCDHGA9-201ENST00000573521 4605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
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