Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB4P17483 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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