Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFTRP13569 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CFTRP13569 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CFTRP13569 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFTRP13569 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CFTRP13569 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFTRP13569 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFTRP13569 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFTRP13569 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CFTRP13569 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFTRP13569 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFTRP13569 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFTRP13569 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFTRP13569 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFTRP13569 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFTRP13569 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFTRP13569 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFTRP13569 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFTRP13569 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFTRP13569 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFTRP13569 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFTRP13569 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFTRP13569 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CFTRP13569 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFTRP13569 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFTRP13569 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CFTRP13569 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFTRP13569 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFTRP13569 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFTRP13569 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFTRP13569 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFTRP13569 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFTRP13569 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFTRP13569 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFTRP13569 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFTRP13569 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFTRP13569 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFTRP13569 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFTRP13569 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFTRP13569 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFTRP13569 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CFTRP13569 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFTRP13569 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFTRP13569 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFTRP13569 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFTRP13569 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFTRP13569 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFTRP13569 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFTRP13569 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CFTRP13569 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFTRP13569 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CFTRP13569 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CFTRP13569 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFTRP13569 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFTRP13569 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFTRP13569 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFTRP13569 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFTRP13569 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFTRP13569 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFTRP13569 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFTRP13569 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFTRP13569 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFTRP13569 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFTRP13569 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFTRP13569 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CFTRP13569 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFTRP13569 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFTRP13569 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFTRP13569 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFTRP13569 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFTRP13569 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFTRP13569 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFTRP13569 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFTRP13569 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFTRP13569 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFTRP13569 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFTRP13569 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFTRP13569 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFTRP13569 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFTRP13569 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFTRP13569 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFTRP13569 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFTRP13569 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CFTRP13569 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFTRP13569 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFTRP13569 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFTRP13569 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFTRP13569 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFTRP13569 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFTRP13569 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFTRP13569 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFTRP13569 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFTRP13569 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFTRP13569 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFTRP13569 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CFTRP13569 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFTRP13569 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFTRP13569 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CFTRP13569 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFTRP13569 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms