Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMP3P12645 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMP3P12645 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMP3P12645 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMP3P12645 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMP3P12645 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMP3P12645 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMP3P12645 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMP3P12645 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMP3P12645 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMP3P12645 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMP3P12645 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMP3P12645 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMP3P12645 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMP3P12645 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMP3P12645 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BMP3P12645 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMP3P12645 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMP3P12645 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMP3P12645 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BMP3P12645 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMP3P12645 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMP3P12645 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP3P12645 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP3P12645 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP3P12645 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP3P12645 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP3P12645 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP3P12645 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP3P12645 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP3P12645 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP3P12645 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP3P12645 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP3P12645 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP3P12645 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP3P12645 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP3P12645 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP3P12645 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP3P12645 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP3P12645 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP3P12645 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP3P12645 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP3P12645 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP3P12645 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP3P12645 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP3P12645 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP3P12645 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP3P12645 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP3P12645 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP3P12645 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP3P12645 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP3P12645 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMP3P12645 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMP3P12645 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMP3P12645 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMP3P12645 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMP3P12645 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms