Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms