Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK4P11802 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK4P11802 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK4P11802 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK4P11802 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK4P11802 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK4P11802 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK4P11802 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK4P11802 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK4P11802 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK4P11802 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK4P11802 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK4P11802 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK4P11802 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK4P11802 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK4P11802 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK4P11802 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK4P11802 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK4P11802 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK4P11802 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK4P11802 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK4P11802 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK4P11802 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK4P11802 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK4P11802 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK4P11802 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK4P11802 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK4P11802 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK4P11802 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK4P11802 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK4P11802 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK4P11802 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK4P11802 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK4P11802 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK4P11802 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK4P11802 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK4P11802 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK4P11802 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK4P11802 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK4P11802 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK4P11802 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK4P11802 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK4P11802 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK4P11802 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK4P11802 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK4P11802 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK4P11802 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK4P11802 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK4P11802 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK4P11802 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms