Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM10L1P0DMW3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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