Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms