Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP2O95045 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP2O95045 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP2O95045 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP2O95045 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP2O95045 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP2O95045 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP2O95045 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP2O95045 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP2O95045 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP2O95045 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP2O95045 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP2O95045 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP2O95045 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP2O95045 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP2O95045 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP2O95045 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP2O95045 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP2O95045 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP2O95045 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP2O95045 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP2O95045 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP2O95045 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP2O95045 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP2O95045 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP2O95045 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP2O95045 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP2O95045 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP2O95045 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP2O95045 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP2O95045 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP2O95045 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP2O95045 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP2O95045 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP2O95045 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP2O95045 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP2O95045 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP2O95045 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP2O95045 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP2O95045 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP2O95045 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP2O95045 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP2O95045 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP2O95045 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP2O95045 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP2O95045 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP2O95045 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP2O95045 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP2O95045 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP2O95045 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP2O95045 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP2O95045 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP2O95045 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP2O95045 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP2O95045 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP2O95045 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP2O95045 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP2O95045 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms