Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COCHO43405 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COCHO43405 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COCHO43405 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms