Protein–RNA interactions for Protein: G5E9R7

KRTAP4-16, HCG2042993, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-16G5E9R7 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP4-16G5E9R7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms