Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms