Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 OSBP2-208ENST00000437268 3580 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 ACADL-201ENST00000233710 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 SRRT-215ENST00000614484 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 SOX30-201ENST00000265007 3265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 FBXO9-202ENST00000323557 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 SLC5A9-203ENST00000438567 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 AC091170.1-201ENST00000582983 2190 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 JAM3-201ENST00000299106 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 CCNG1-201ENST00000340828 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 PHF21B-202ENST00000396103 3540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 PARG-207ENST00000616448 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms