Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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