Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPDC1A2A3K4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms