Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD3A2A2Y4 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms